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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性鱼类特女性朋友、寡核苷酸体现价格高或操作使用方法复杂化。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教学项目团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低的成本、跨种群、全网上平台兼容的全新解决方案。

期刊杂志简绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的国家人学科实验院显性基因与发育期动物制品学学习所和我国的国家人显性基因学得会主办人的全球学术界小学科学研究杂志杂志,锐意创新于新闻稿宝宝学科实验和医学小学科学研究显性基因学教育方面的亚无性学习收获。JGG 2026年度影晌细胞因子7.1,Scopus学术界小学科学研究杂志杂志点评指数CiteScore 9.9,位于JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY教育方面Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY教育方面Q1区,位于我国的国家人学科实验院杂志杂志设计布局动物制品学种类别1区(Top杂志杂志),显性基因学和什么是生化与原子动物制品学小类双1区。

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一些 是HEATag

合理的“二融合”来设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶产生的相融合血清

「标记器」传感器 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「接器」模块图片 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索长条码参与共价链接。

“1+1>2”的成果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行模板记号与溯源系统。

Fig1: HEATag多种标注道理表示图

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实战演练测试

HEATag到最后有大多能打?

还可以在不同于前提条件下,建立母乳喂养猎物内部膜系单内部膜混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。深入分析精英团队为 HEATag 设有了多轮 “压力值测试英文”,从人体细胞膜系到人体细胞膜核,从室温到低温环境,从新鲜样例到紧固样例,全方法证实它的耐用性和耐用性。

首个轮测试仪采取喂母乳生物癌受损细胞系系:探析者的选择了来自于人、鼠、仓鼠五个种类的三种癌受损细胞系(HEK293T、K562、MEF、CHO),在恒温下使用 HEATag 标记图片后混和测序。结果英文收回的 11447 个癌受损细胞系中,85.66% 都能能够 HEATag 长形码精确搭配到原种类,样例间平行被污染的非常少,UMAP 聚类探讨探讨无论是一直表明,HEATag 长形码与种类非特异聊天什么是基因组优点层面不一样。 紧接着,测评生活水平进一步的骤晋级:研发人品尝在 4℃下箭头剥好的组织血肿瘤细胞系系、在温度下箭头甲醇放置组织血肿瘤细胞系系,恐怕会箭头组织血肿瘤细胞系系核。结局依旧闪亮:所有的生活水平下,样例标示与种群信息内容均更具很棒的一些性,转换精确性率超 95%。纵使甲醇放置会致使稍微的转录本交叠环境破坏,组织血肿瘤细胞系系核分离纯化会起一点 RNA 引流,组织血肿瘤细胞系系形式的参考文献标注结局依旧与剥好的样例保持着高度,证明文件 HEATag 可箭头有所差异正确处理生活水平下的试验样例。

Fig2: HEATag 可在不同的标准下进行单内部转录组混样阐述

才可以箭头喂母乳生物和海洋资源无脊椎神经生物的原代组织

只要说細胞系测试方法是 “基础条件题”,那组织化样表就会 “叠加题”, 这部分样表总是因細胞类型的冗杂、坏境适宜性层次性,变成图标能力的 “关键问题”,而 HEATag 正好在这部分 “关键问题” 上体现了强势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸进行,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞实际上能被明确分,整个主要癌细胞类的聚类分析结局都不清可辨。

更令人惊喜的是HEATag对浅海生物技术的兼容性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条型码与植物物种转录组有较高不一样性,不会有出显因高盐生态诱发的 “标识无效”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可达成母乳喂奶各种动物组织化样品诸多 scRNA-seq 定量分析

Fig4: HEATag可保持优质浅海无脊椎神经绿色许多 scRNA-seq 分折

HEATag与細胞的组合就不会带来转录组的显著性变动

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在进行标记图片主线任务的此外,不可能对事件调查的转录多组分析会导致侵扰,切实保障了科学研究数据源的现实性。

Fig5: HEATag不太会不良影响样例的 RNA 表达方式基本模式

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前景可期

HEATag 能为单组织调查给我们那些?

HEATag 的價值,远禁不住于 “搞定标识问题”,它的灵活多变性和普遍性,已经为单受损细胞探索加载越来越多可以性

从APP游戏场景一起来看

HEATag 能盖住从 “方便较为数据分析”(如癌安排性与正常人安排性、抗癫痫药物外理与對照)到 “新一波较探讨”(如安排性组织图谱画出、mtk量诉求)的全领域诉求。随 PIP-seq、Stereo-cell 等新兴可括展能力的开发,HEATag 还能进一歩提升自己单组织探讨的通量,推助科技创新精英团队进行更新一波较的该项目。

从跨方面优势来讲

HEATag 不只适用性于转录组学,还能与表观什么是基因组学、蛋白酶质组学、区域空间组学等枝术构建,采用订做检索和寡核苷酸字段,HEATag 能否轻易渗透不同于的组学流量,不关系信号灯捕捉深浅。并且,针对HEATag还能否发展趋势单内部糖组学实验枝术。

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合作方式动向

拜谱生物制品与陈凯硕士生导师达到目标进行初步合作项目的想法

应当青睐的是,在 HEATag 高技術设备能够出大广泛应用软件实力的后台下,拜谱动物已与我国南方深海物理学与施工佛山實驗室(武汉)陈凯教援完成首次协议想法。男女双方预计围绕着 HEATag 高技術设备的家产化落子、调查导出等走向做好角度区域合作,统筹推进这一项成本低费、跨种类的单受损血组织箭头高技術设备更加快广泛应用软件于实计调查场景设计,为多實驗室能提供高效、性价比最高、划算的单受损血组织调查的工具,转向调查任务者在受损血组织动物学、深海动物学、患病系统等前沿技术作为多打破
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