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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
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近日,广州医科学校生首个附带三甲医院王学浩工程院院士技术团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗人体脂肪代谢率检测分析服务。

因为版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

中文翻译标题文字:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

客人的单位:南京医科大学

研究探讨文件:细胞

拜谱给出精准服务:转录组测序+血清互作组+靶点精力排泄组

的技术风格:

研究方案结果显示

01、YBX1被亲子鉴定为HCC中糖酵解的核心基因组

本研发统计资料采集HCC肉瘤模本(n=7)的单生殖癌细胞系RNA测序统计资料集完成分享,察觉糖酵解可溶性重点集合在肉瘤生殖癌细胞系中,hdWGCNA分享掌握出9个dna接口(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的长期生活分享明确YBX1为自立长期生活风险控制影响因素(图1H)。进步骤结合在一起IHC、WB测试和肉瘤企业与周围非肉瘤企业的服务器转录组学统计资料集验证YBX1是肝生殖癌细胞系癌诊治的自身靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被知道为的调节HCC组织糖酵解的要点原则

02、YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和繁殖

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗消耗的能量细胞代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和增值能力

03、OGT与YBX1联系并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1综合并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷硝化作用,而使增强其核转位

进的一次查测YBX1的O-GlcNAc糖基化可否关系其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC组织中或用OGT可以抑中药制剂OSMI-1净化处理,YBX1核淀粉酶情况取得降低了,YBX1磷酸性反应取得抑制(图4A-C)。IP实践展现,在相同之处的Flag-YBX1底物情况下,YBX1-WT的磷酸性反应情况取得低于YBX1-T57A,证明磷酸性反应的加剧这样不只是这是由于更高的的YBX1核淀粉酶展示(图4D)。分离法了核和质类物质看到TMG净化处理的HCC组织中YBX1核展示的提高(图4E-F),进的一次看到YBX1磷酸性反应的重点调高因素是AKT(图4G-I)。这看到关注O-GlcNAc糖基化采用可以淡化其磷酸性反应来提高YBX1核淀粉酶可靠性并可以淡化核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现有益于于其进1步突发磷碱化体现并就能利于其核转位

05、YBX1驱动PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1增进PKM2转录

06、YBX1 才能提升组蛋清乳酸性反应修饰语质量

探析会发现YBX1敲低为强势有效减低膳食纤维质乳过酸,特别是在是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解治理和改善剂2-DG的实验设计声明了糖酵解与组膳食纤维乳过酸的马上关联关系,治理和改善糖酵解可为强势有效减低H3K18la平行(图6D)。PKM2过理解不可逆转转YBX1敲低所导致的H3K18la变低,以外源乳酸办理不禁加快H3K18la,还引发YBX1理解上涨,报错长期存在正向着反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR声明,H3K18la确认生物富集于YBX1启动时子马上利于其转录,该阶段受O-GlcNAc糖基化国家宏观调控(图6H-J),并会发现P300 上涨是YBX1提高H3K18乳酰化做用的策略(图6K-L)。

图6.YBX1激发H3K18乳碱化绘制标准

一篇文章工作小结

在这方面深入分析中报导了YBX1在HCC中高形容,与此同时与糖酵破解切有关。YBX1在T57处被O-GlcNAc呈现,然而稳定性高蛋清质并增大其形容。此类呈现还有利于改善YBX1在T57处的磷过酸,有利于改善其核易位。故此,这整个过程改善了糖酵解有关基因遗传组的转录并兴奋乳酸的诞生。因此,YBX1成功激活P300的转录,以致推动组蛋清的乳过酸,很是H3K18la,H3K18乳过酸正方向控制YBX1基因遗传组转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观遗传病正反面馈环机能图

拜谱工作小结

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱怪物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶点能量是什么排泄组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、翻譯后掩盖组学、分泌组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

规范文章

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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