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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生态学mRNA中最猛要的转录后呈现,在真核生态学的方面的问题和生活的过程中起着至关关键的的功效。尿毒症认知能力困难一种不可逆反应的脑神经末梢脑神经系统的退行内分泌疾病症状,现在发展壮大那就是切考核机制无权可以揭示,另外存在有郊的防止和诊疗有效途径。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物工程为其提供m6A甲基化了解技术设备服務,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

的文章命名:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

合作方方:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

钻研产品:小鼠脑组织

拜谱供给技术应用:m6A甲基化(MeRIP-seq)

引言图:

图1| 内容提要图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

理论研究的结果

1.DCI小鼠海马中m6A基因组掩盖的修改

研发方案的人士第一方面建设了高脂膳食和认同心里障碍(DCI)的小鼠模型工具。为很参考组(n = 3)和DCI组(n = 3)间的m6A遗传染色体淡化,研发方案的人士利用MeRIP-seq来了转录组区间内的m6A-seq讲解。在DCI组的10664个代码遗传染色体转录物(mRNAs)共产党会发现参考组的2371一个不从叠的m6A峰。不同之处的情况下,DCI组表現出23,75一个非从叠m6A峰。之中,9343个甲基化遗传染色体在参考组和DCI组间从叠(图2)。

图2| 较组和DCl组m6a掩盖DNA的维恩图

共鉴别出127九个距离甲基化的m6A位点(DMMSs),其中的60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化品质分为正相关高过差表组。具体分析其规划问题表明m6A峰规划在整块RNA中(图3A),并依据其规划的转录地区分为有以下五组:5'UTR、3'UTR、转录开始和结束位点地区细节描写、中止账号支付密码锁子细节描写、开始和结束账号支付密码锁子细节描写和打码回文序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和中止账号支付密码锁子周边正相关生物富集(图3B)。想要分析评估报告格式一些dna上m6A淡化的地区,钻研成员选择了有峰标注的地区,并测定法了一些dna上reads的覆盖住率。在DCI组中,m6A淡化区倾斜于3'UTR区(图3C)。各个mRNA内的DMMS都被位置到复染体进去分析评估报告格式其规划概述。有差异小鼠复染体的m6A淡化谱有差异。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的调整

为了能让测试m6A体现在DCI小鼠中的海洋生理学实用功能,研究定性研究的人员从两个各写择所含DMMS的核蛋白编码查询染色体展开GO和KEGG定性研究(图4A)。在GO定性研究中,高甲基化染色体在神经元历程、海洋怪物历程调整、促使剂的作用化学活化和杂环有机酸物整合中差异性生物聚集。KEGG通道定性研究凸显,高甲基化染色体与T神经元肾上腺素感觉走势通道、小神经元肺腺癌和RIG-I样肾上腺素感觉走势通道重要性(图4B)。对于那些低甲基化染色体,GO定性研究凸显在神经元历程、新陈代谢历程和整合历程中差异性生物聚集有机酸环有机酸物、整合杂环有机酸物和促使剂的作用化学活化(图4C)。KEGG通道定性研究阐释了低甲基化染色体与肥厚性心肌病和Hippo走势通道的同步(图4D)。

图4| 之间的关系甲基化m6A位点的通道聚集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据表格的综合深入分析

后来调查人士将m6A MeRIP-Seq的数值和仍然RNA-Seq的数值做出联合技术分折,找到163个mRNA,m6A峰和mRNA水准明显变。41种mRNA的m6A和mRNA水准上涨,14种mRNA水准下降。因此,30个表观遗传mRNA表达出来方法上涨,m6A水准下降,7八个表观遗传mRNA表达出来方法下降,m6A水准上涨(图5A)。后,建设了了个PPI网络上来展现163个表观遗传编码查询的蛋白酶内的相连接(图5B)。

如下图提示6提示,GO和KEGG了解分类四组:(1) m6A调整,mRNA下降;(2) m6A调整,mRNA调整;(3) m6A下降,mRNA下降;(4) 人类DNA组m6A下降和mRNA调整。在GO了解中,m6A调整和mRNA下降的人类DNA组在组织膜系分解基础排泄率步骤、果香族单质生物学人工步骤和RNA分解基础排泄率步骤的房产房产调控中不错生物含有。KEGG了解表现,这样的人类DNA组在油脂酸分解基础排泄率、小组织膜系非小组织肺癌、丙酸分解基础排泄率和甲苯酸分解基础排泄率中生物含有。我们对m6A调整和mRNA调整的人类DNA组,GO了解表现在亚铁相融入、亚胺丙氨酸脱羧酶抗逆性、天冬氨酸1-脱羧酶抗逆性和组织膜系相连拆装负房产房产调控中生物含有;KEGG了解表现在2型血糖高、油脂组织膜系因素数据通道和胰岛素数据通道中生物含有。在GO了解中,m6A下降和mRNA下降的人类DNA组在寡肽相融入、谷胱甘肽相融入和二硫钝化物钝化复原酶抗逆性中生物含有,而在KEGG了解中,其在柠檬片酸嵌套循环系统(TCA嵌套循环系统)、丙酸分解基础排泄率和多种类凋亡中生物含有。在GO了解中,m6A下降和mRNA调整的人类DNA组在胚胎骨软骨基本特征造成、血清激酶抗逆性刺激启动和NADP分解基础排泄率步骤中生物含有,在KEGG了解中,m6A下降和mRNA调整人类DNA组在新霉素、卡那霉素和神经末梢膳食纤维因素数据通道中生物含有。

图5| m6A甲基化与mRNA表达出的结合介绍

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG概述

拜谱动物个人心得体会

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生态学提供了m6A甲基化技术设备业务,拜谱动物可提供完善成熟的核蛋白组学、代谢率组学、转录组学或是多个学联合科技厂品科技服務,欢迎致电咨询!

对比文献综述:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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